Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms