Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPOCD1Q6ZMY3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms