Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms