Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 WDR35-203ENST00000414212 3483 ntTSL 53.34□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ANGPTL8-202ENST00000587543 432 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX5-206ENST00000469704 696 ntTSL 322.79■■□□□ 1.248e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 PIM1-202ENST00000468243 818 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.941e-29■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ACBD4-210ENST00000589752 804 ntTSL 312.09□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 32.9
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