Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCTP1Q6DN14 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms