Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms