Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AKAP4Q5JQC9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
AKAP4Q5JQC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AKAP4Q5JQC9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AKAP4Q5JQC9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AKAP4Q5JQC9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AKAP4Q5JQC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AKAP4Q5JQC9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms