Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms