Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms