Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP100Q494V2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms