Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC57Q2TAC2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms