Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CDO1Q16878 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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CDO1Q16878 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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