Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUM3Q15397 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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