Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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