Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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HERPUD1Q15011 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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HERPUD1Q15011 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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