Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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