Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RAB39AQ14964 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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