Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TNNI3-204ENST00000586669 477 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 PAXX-205ENST00000483807 705 ntTSL 518.64■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.544e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TNNI3-208ENST00000589864 525 ntTSL 218.42■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GUK1-222ENST00000477206 589 ntTSL 218.01■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GUK1-239ENST00000498115 796 ntTSL 517.9■□□□□ 0.462e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 PAXX-208ENST00000498095 1077 ntTSL 517.53■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 MYBBP1A-205ENST00000571368 1995 ntTSL 217.38■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CNOT3-206ENST00000471126 541 ntTSL 317.24■□□□□ 0.352e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 UBXN6-207ENST00000591919 1613 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-11■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 315.58■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 SDHA-218ENST00000515752 1809 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 UBXN6-205ENST00000588238 4598 nt14.27□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 514.24□□□□□ -0.134e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 PRKCSH-218ENST00000593053 588 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.387e-9■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 PRKCSH-207ENST00000588269 557 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 KMT2A-208ENST00000529852 3323 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SDHA-216ENST00000514027 2209 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CLUH-206ENST00000572129 480 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-9■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TRIM25-204ENST00000570749 614 ntTSL 210.3□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.778e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.788e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRRM2-224ENST00000575870 696 ntTSL 39.88□□□□□ -0.832e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 29.55□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TRIM25-203ENST00000570473 498 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DDX42-204ENST00000577940 1427 ntTSL 58.87□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 MAP4K4-214ENST00000477711 606 ntTSL 28.76□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP6V1E1-208ENST00000481365 692 ntTSL 47.44□□□□□ -1.222e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP6V1E1-207ENST00000478963 587 ntTSL 27.06□□□□□ -1.282e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 36.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP5J2-207ENST00000481899 738 ntTSL 26.42□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 8.9
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