Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE1CQ14123 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE1CQ14123 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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