Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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