Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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