Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.135e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.065e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-207ENST00000587630 1191 ntTSL 315.23■□□□□ 0.035e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.035e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.035e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-10■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 LGALS1-204ENST00000464120 303 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-25■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 LGALS1-206ENST00000480207 185 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-25■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.493e-11■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.873e-11■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 520.35■□□□□ 0.853e-11■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.73e-11■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 HNRNPM-216ENST00000602219 1809 nt16.5■□□□□ 0.233e-11■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 MPG-205ENST00000475280 510 ntTSL 222.7■■□□□ 1.226e-7■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 17.9
PABPC4Q13310 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.786e-13■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.016e-13■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.086e-13■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.326e-13■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 522.68■■□□□ 1.222e-11■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 HMBS-219ENST00000544182 1542 ntTSL 215.24■□□□□ 0.032e-11■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 RPL9-207ENST00000506581 371 ntTSL 57.05□□□□□ -1.283e-31■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 RTN4-215ENST00000491592 860 ntTSL 25.83□□□□□ -1.483e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 MRPS14-203ENST00000498253 539 ntTSL 214.44□□□□□ -0.18e-17■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 MRPS14-201ENST00000367677 910 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.18e-17■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 MRPS14-202ENST00000476371 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.68e-17■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.668e-17■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 524.59■■□□□ 1.533e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 EIF3G-209ENST00000589674 596 ntTSL 215.29■□□□□ 0.043e-13■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 HSPA4-203ENST00000514825 690 ntTSL 26.9□□□□□ -1.35e-12■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 EHBP1L1-203ENST00000527214 543 ntTSL 224.59■■□□□ 1.532e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 EHBP1L1-206ENST00000529596 799 ntTSL 524.37■■□□□ 1.492e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 EHBP1L1-204ENST00000529056 461 ntTSL 223.9■■□□□ 1.422e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-10■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 MRPS24-205ENST00000483330 392 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-12■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.562e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-210ENST00000627604 565 ntTSL 426.19■■□□□ 1.782e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 17.8
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PABPC4Q13310 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.545e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-204ENST00000465887 2118 ntTSL 218.06■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-206ENST00000489647 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 17.8
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PABPC4Q13310 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 POLR1D-222ENST00000637389 129 ntTSL 51.04□□□□□ -2.242e-6■■■□□ 17.8
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PABPC4Q13310 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-18■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 RPL29-205ENST00000480306 719 ntTSL 210.9□□□□□ -0.661e-18■■■□□ 17.8
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PABPC4Q13310 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 DGAT1-203ENST00000524965 1336 ntTSL 516.2■□□□□ 0.185e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.639e-29■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.49e-11■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.229e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.241e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-26■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-26■■■□□ 17.8
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PABPC4Q13310 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-26■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 KLF6-203ENST00000461124 764 ntTSL 518.56■□□□□ 0.566e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.056e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.346e-8■■■□□ 17.8
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PABPC4Q13310 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 MARCH7-204ENST00000420397 983 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.532e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-9■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-9■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.241e-9■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.664e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 418.87■□□□□ 0.614e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 218.6■□□□□ 0.574e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 PKN1-204ENST00000585839 3518 ntTSL 220.66■□□□□ 0.99e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.859e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.169e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 231.01■■■□□ 2.553e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 518.13■□□□□ 0.493e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 COLGALT1-202ENST00000593832 2941 ntTSL 215.25■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 USF2-211ENST00000599471 1173 ntTSL 320.76■□□□□ 0.917e-8■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 COX7A2L-205ENST00000464443 895 ntTSL 322.29■■□□□ 1.167e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 COX7A2L-208ENST00000607768 614 ntTSL 311.33□□□□□ -0.67e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.812e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.913e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.913e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-210ENST00000637920 1093 ntTSL 222.43■■□□□ 1.183e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.133e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-203ENST00000413013 806 ntTSL 221.62■■□□□ 1.053e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.993e-7■■■□□ 17.8
PABPC4Q13310 SMIM29-204ENST00000463083 1487 ntTSL 220.93■□□□□ 0.943e-7■■■□□ 17.8
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