Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLAMF1Q13291 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLAMF1Q13291 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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