Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLFQ13129 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLFQ13129 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLFQ13129 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLFQ13129 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RLFQ13129 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLFQ13129 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLFQ13129 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLFQ13129 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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