Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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