Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFCP2Q12800 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFCP2Q12800 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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