Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms