Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FMODQ06828 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FMODQ06828 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms