Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms