Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms