Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MPP1Q00013 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms