Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL7P80098 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL7P80098 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL7P80098 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCL7P80098 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL7P80098 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms