Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2FP61218 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms