Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAG2P55895 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms