Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA8P53708 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA8P53708 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms