Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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