Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRE11P49959 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms