Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFBP49765 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFBP49765 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFBP49765 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFBP49765 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms