Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPHP49418 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPHP49418 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms