Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms