Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX5P48382 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFX5P48382 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX5P48382 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX5P48382 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX5P48382 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms