Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF4P34130 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTF4P34130 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms