Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBL1P28749 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBL1P28749 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBL1P28749 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBL1P28749 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms