Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FGFR4P22455 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR4P22455 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms