Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHCEP18577 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHCEP18577 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHCEP18577 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHCEP18577 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms