Protein–RNA interactions for Protein: P14635

CCNB1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1P14635 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNB1P14635 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms