Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms