Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC166P0CW27 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms