Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOA1P02647 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOA1P02647 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms