Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms